船籍港
政府通常要求船主有相应的执照与注册登记。飞船需要在某一III级、IV级或V级港口注册，将这个港口称为“船籍港”。
在少为人知的港口或者因犯罪猖獗出名的港口注册，会引来海关的关注！
太空船是其船籍港所在国或所属组织的主权领土。船和船员受船籍港的法律、规范、税务约束，包括CR和武器拥有方面的限制。但具体内容由船注册于大国政府还是“方便旗”决定。部分文化赋予船长在船上一定的执法权力。
下面介绍了船籍的四个大类：国家政府、方便旗、可疑港口、双重注册。在任何CR1的港口运营商船一般都需要登记。
没有船籍的船可能被禁止收容货物或旅客，甚至被有关部门没收。
国家 政府 船籍
船主可以将船只注册在本国政府管辖之下。有些社会里这是对所有船只的法律要求，而有些社会里这是可选项目。
这一过程可能涉及将船注册到某一政体名下的具体港口（“我们注册在火星联邦的罗威尔港”）、注册到特定的世界（“我们注册在太阳系的泰拉”）或者横跨多个世界的国家（“我们是银河联邦的船”）。
国家政府的船籍会要求船主上缴利润相关的所得税，如果颁发的政府需要缴纳这种税的话。同样他也需要遵循一系列法律和行业规范。从另一方面来说，因为政府的贸易促进意向，政府船籍的收费通常不高。典型的收费是固定的每吨$0.5或者全船$1000（二者取高），不收取年费。
注册船籍需要满足相应的规范标准。由GM决定需要满足什么规范，但对于商业太空船，下面的内容可能是标准要求：
接受验证船舶安全性的检查遵守这个社会正常的公司/私人经营法律与劳动法*雇佣的船员需要拥有对应的资格或执照，比如飞行员执照。GM可能默认有合适的技能与背景的人都有执照，但非公民、少数族裔、罪犯等可能需要假证！
*确保船只装备有救生装备；例如，每一位船员与乘客配备的太空服或救援泡（Ultra-tech，77页），以及如果船只能在世界表面降落的话，配备医疗与生存设备（口粮、临时住所等）。
特定的业务可能还需要满足专门的要求。例如有人长期居住的飞船可能要求每携带10名旅客就需要配备1位医生。
除此之外的法规也有可能；GM可以设置符合战役的任何法规。（“太空多样性法案要求所有地球联邦商船上至少有一位高级船员属于非人类出身：机器人、智慧动物、混合体或外星人”）
如果太空船遭遇了本国的海军或巡逻队舰艇，相应的权力机构可能进行临检来确认飞船符合上述规范，如果未能合规可能会被处以罚金甚至更严重的处罚。罚金最低等于基础注册费。
国家政府船籍是获得资助（27页）的前提，而且在混乱时期，港口权力机构、海军与巡逻队对不属于本国或盟友的船只，都可能怀疑甚至公然流露出敌意。并且因为船只属于船籍国主权管辖下的领土，另一国家的行为体侵犯这一主权可能被认为是战争行为。国际条约可能规定军或警船只，在有重大犯罪活动或间谍活动嫌疑的情况下，可以实施要求停止、登船与搜查。
但如果商船的船籍是某个大国，弱国的人员在这艘商船惹上麻烦时也会小心行事。例如，如果地方独裁政权的腐败海关官员知道侵害地球帝国商船会引发外交事件（代价是他们的位子）的话，就不太可能施展什么“下马威”。另一方面来说，如果发生了冲突，敌国船籍的船碰巧在“国境线错误的一边”就可能被俘获（如果战争突然爆发的话会遇上这种情况），其他情况下也会被私掠者或破交舰队攻击。
方便 旗船 籍
在众多进行太空飞行的社会中，商船将船籍注册在与大多数大国关系友好、称为“方便旗”的中立小国，可能是常见行为。注册方便旗需要接受更高的收费，但也可以避免税收，减少甚至回避监管。另外方便旗可能让商船可以在有敌意的双方领土内都能畅通无阻，但在战时这种中立未必能保下船。方便旗的主要优点还是不用按利润交纳所得税。
新船把船籍注册在方便旗名下，或者老船转换船籍港，需要满足一定的要求：
- 现状身份证明文件，以便船籍港方面进行基本的背景审查。在船籍港所属政府，以及与其有引渡条约的政府的管辖范围内没有重大犯罪记录。
港一方的人员进行全面检查。一般费用是每吨$0.1，需要1d天。或者如果属于转换船籍，如果转出方是声誉良好的同盟国港口，转入地可能接受外方证明。这就免去了在船籍港靠泊的需要，并且为船主节省了一笔开支。
- 支付固定的每吨$0.5或者全船$1000（二者取高），年费为注册费用的10%。当注册100000+吨位航线时，注册费（不包括年费）可能获得-50%的“公司船队折扣”
有些港口可能声名狼藉，或者干脆就是盗匪老巢。这种港口的注册费是最低的，只要求很少的技术或拥船证明（甚至完全不要求），并且费用是个固定值（例如不收年费的$100000）。但当地权力部门可能知道这种松懈，所以对来自这种港口的飞船都不免被海关人员骚扰、被怀疑是海盗或走私者，等等。为模拟这种情况，船长应该获得一个负面的声誉（大小取决于港口的情况，频率取决于其恶名远播的程度）。
双重 船籍
国家可能达成协议，让飞船能注册在不止一个管辖区名下，受多个政府或方便旗管辖。对于需要频繁跨越星际边界进行贸易的飞船来说，这可以减少海关纠葛并保证官方提供保护，所以是有用的。基本上，船需要交两边的税、费和证（除非条约里明确免除了），但可以轻松地跨国运营。当然，如果两国之间开战，双重船籍的船就会被双方怀疑。它可能被困在中间骑虎难下，船长与船员必须选边站队。